hmdb_data_fields

# HMDB 数据字段参考 本文档提供了 HMDB 代谢物条目中可用数据字段的详细信息。 ## 代谢物条目结构 每个 HMDB 代谢物条目包含 130+ 个数据字段，分为多个类别： ### 化学数据字段 **标识：** - `accession`: 主要 HMDB ID (例如 HMDB0000001) - `secondary_accessions`: 合并条目之前的旧 HMDB ID - `name`: 主要代谢物名称 - `synonyms`: 别名和常用名 - `chemical_formula`: 分子式 (例如 C6H12O6) - `average_molecular_weight`: 平均分子量 (道尔顿) - `monoisotopic_molecular_weight`: 单同位素分子量 **结构表示：** - `smiles`: 简化分子线性输入规范字符串 - `inchi`: 国际化学标识符字符串 - `inchikey`: 用于快速查找的哈希化 InChI - `iupac_name`: IUPAC 系统名称 - `traditional_iupac`: 传统 IUPAC 名称 **化学性质：** - `state`: 物理状态（固体、液体、气体） - `charge`: 净分子电荷 - `logp`: 辛醇-水分配系数（实验值/预测值） - `pka_strongest_acidic`: 最强酸性 pKa 值 - `pka_strongest_basic`: 最强碱性 pKa 值 - `polar_surface_area`: 拓扑极性表面积 (TPSA) - `refractivity`: 摩尔折射率 - `polarizability`: 分子极化率 - `rotatable_bond_count`: 可旋转键数量 - `acceptor_count`: 氢键受体数量 - `donor_count`: 氢键供体数量 **化学分类：** - `kingdom`: 化学界 (例如有机化合物) - `super_class`: 化学超类 - `class`: 化学类 - `sub_class`: 化学子类 - `direct_parent`: 直接化学母体 - `alternative_parents`: 替代母体分类 - `substituents`: 存在的化学取代基 - `description`: 化合物的文字描述 ### 生物学数据字段 **代谢物来源：** - `origin`: 代谢物来源（内源性、外源性、药物代谢物、食物成分） - `biofluid_locations`: 发现的生物流体（血液、尿液、唾液、脑脊液等） - `tissue_locations`: 发现的组织（肝脏、肾脏、大脑、肌肉等） - `cellular_locations`: 亚细胞位置（细胞质、线粒体、膜等） **生物样本信息：** - `biospecimen`: 生物样本类型 - `status`: 检测状态（已检测、预期、预测） - `concentration`: 浓度范围及单位 - `concent