query_syntax

# UniProt 查询语法参考 UniProt 搜索查询语法的综合指南，用于构建复杂的搜索请求。 ## 基础语法 ### 简单查询 insulin kinase ### 特定字段搜索 gene:BRCA1 accession:P12345 organism_name:human protein_name:kinase ## 布尔运算符 ### AND（必须同时包含两个词） insulin AND diabetes kinase AND human gene:BRCA1 AND reviewed:true ### OR（包含其中任意一个词即可） diabetes OR insulin (cancer OR tumor) AND human ### NOT（排除词汇） kinase NOT human protein_name:kinase NOT organism_name:mouse ### 使用括号进行分组 (diabetes OR insulin) AND reviewed:true (gene:BRCA1 OR gene:BRCA2) AND organism_id:9606 ## 常用搜索字段 ### 标识信息 - `accession:P12345` - UniProt 登录号 - `id:INSR_HUMAN` - 条目名称 - `gene:BRCA1` - 基因名称 - `gene_exact:BRCA1` - 精确匹配基因名称 ### 生物/分类学 - `organism_name:human` - 生物名称 - `organism_name:"Homo sapiens"` - 精确生物名称（多词请使用引号） - `organism_id:9606` - NCBI 分类 ID - `taxonomy_id:9606` - 同 organism_id - `taxonomy_name:"Homo sapiens"` - 分类名称 ### 蛋白质信息 - `protein_name:insulin` - 蛋白质名称 - `protein_name:"insulin receptor"` - 精确蛋白质名称 - `reviewed:true` - 仅限 Swiss-Prot（已审阅）条目 - `reviewed:false` - 仅限 TrEMBL（未审阅）条目 ### 序列属性 - `length:[100 TO 500]` - 序列长度范围 - `mass:[50000 TO 100000]` - 分子量（道尔顿） - `sequence:MVLSPADKTNVK` - 精确序列匹配 - `fragment:false` - 排除片段序列 ### 基因本体论 (GO) - `go:0005515` - GO 条目 ID (0005515 = 蛋白质结合) - `go_f:* ` - 任何分子功能 - `go_p:*` - 任何生物过程 - `go_c:*` - 任何细胞组分 ### 注释 - `annotation:(type:signal)` - 具有信号肽注释 - `annotation:(type:transmem)` - 具有跨膜区域 - `cc_function:*` - 具有功能注释 - `cc_interaction:*` - 具有相互作用注释 - `ft_domain:*` - 具有结构域特征 ### 数据库交叉引用 - `xref:pdb` - 具有 PDB 结构 - `xref:ensembl` - 具有 Ensembl 引用 - `database:pdb` - 同 xref - `database:(type:pdb)` - 替代语法 ### 蛋白质家族与结构域 - `family:"protein kinase"` - 蛋白质家族 - `keyword:"Protein kinase"` - 关键词注释 - `cc_similarity:*` - 具有相似性注释 ## 范围查询 ### 数值