slide_management

# 切片管理 ## 概述 `Slide` 类是 Histolab 中处理全切片图像（WSI）的主要接口。它提供了加载、检查和处理存储在各种格式中的大型病理图像的方法。 ## 初始化 python from histolab.slide import Slide # 使用 WSI 文件和输出目录初始化切片 slide = Slide(processed_path="path/to/processed/output", slide_path="path/to/slide.svs") **参数：** - `slide_path`: 全切片图像文件的路径（支持多种格式：SVS、TIFF、NDPI 等） - `processed_path`: 保存处理后输出（切片、缩略图等）的目录 ## 加载示例数据 Histolab 提供了来自 TCGA 的内置示例数据集，用于测试和演示： python from histolab.data import prostate_tissue, ovarian_tissue, breast_tissue, heart_tissue, kidney_tissue # 加载前列腺组织样本 prostate_svs, prostate_path = prostate_tissue() slide = Slide(prostate_path, processed_path="output/") 可用的示例数据集： - `prostate_tissue()`: 前列腺组织样本 - `ovarian_tissue()`: 卵巢组织样本 - `breast_tissue()`: 乳腺组织样本 - `heart_tissue()`: 心脏组织样本 - `kidney_tissue()`: 肾脏组织样本 ## 关键属性 ### 切片尺寸 python # 获取 0 级（最高分辨率）的切片尺寸 width, height = slide.dimensions # 获取特定金字塔级别的尺寸 level_dimensions = slide.level_dimensions # 返回每个级别的 (width, height) 元组 ### 放大倍率信息 python # 获取基础放大倍率（例如 40x, 20x） base_mag = slide.base_mpp # 0 级时的每像素微米数 # 获取所有可用级别 num_levels = slide.levels # 金字塔级别数 ### 切片属性 python # 访问 OpenSlide 属性字典 properties = slide.properties # 常见属性包括： # - slide.properties['openslide.objective-power']: 物镜倍率 # - slide.properties['openslide.mpp-x']: X 方向每像素微米数 # - slide.properties['openslide.mpp-y']: Y 方向每像素微米数 # - slide.properties['openslide.vendor']: 扫描仪厂商 ## 缩略图生成 python # 获取特定大小的缩略图 thumbnail = slide.thumbnail # 将缩略图保存到磁盘 slide.save_thumbnail() # 保存到 processed_path # 获取缩放后的缩略图 scaled_thumbnail = slide.scaled_image(scale_factor=32) ## 切片可视化 python # 显示带有 mat 的切片缩略图